Forge DGA

Une version 3.0 d'essai de FImpute (valide jusqu'au 05/05/2019) vient d'être installée sur les noeuds du cluster.

Cette version ne doit pas être lancée sur dga20. Il faut donc utiliser SGE pour lancer cette version par la commande : FImpute3

La documentation a été mise à disposition dans la Forge du département
https://forge-dga.jouy.inra.fr/projects/ctig-env-base/wiki/Loggen#FImpute

La relance du serveur d'archivage va prendre plus de temps que prévu. Le système est en train de "checker" les différents filesystems dont la taille est de plusieurs teras.
Une annonce sera faite lorsque le serveur sera à nouveau disponible

Le serveur d'archivage sera indisponible du vendredi 29 mars 2019 à 15h00 au mardi 02 avril aux alentours de 12h00.
Le CEA, le partenaire INRA pour le Datacenter Ile de France, effectuera la révision technique et les tests réglementaires annuels des installations techniques durant cette période (du 01 avril 2019 à 08h00 au 02/04/2019 12h00).

Il est désormais possible, pour les jobs lancés en qarray, de spécifier dès le lancement de qinfo le numero de la tache dont on veut récupérer les détails. Voir l'option -t dans le mode d'emploi (lancer qinfo sans paramètre) ou sur la page wiki.

[[https://forge-dga.jouy.inra.fr/projects/ctig-env-base/wiki/Logutil#qinfo]]

Amusez vous bien,
Eric

L'outil qinfo disponible sur DGA20 a été mis à jour.

Il permet à tout utilisateur d'avoir une synthèse des jobs en cours sur DGA-CLUSTER (option -n) ou d'obtenir un bilan des différents jobs terminés avec la mémoire réellement utilisée (à comparer avec la mémoire demandée à priori par h_vmem) (option -u) ou d'obtenir des informations plus précises sur un job donné (option -j).

qinfo récupère les informations du mois en cours par défaut. I est aussi possible de récupérer des informations des mois précédents en précisant le mois souhaité avec l'option -d MM/AAAA.

Toutes les informations sont disponibles en tapant qinfo dans un terminal sans paramètre ou sur la page WIKI des utilitaires disponibles au CTIG:

[[https://forge-dga.jouy.inra.fr/projects/ctig-env-base/wiki/Logutil#qinfo]]

Amusez vous bien,
Eric

dga20 est à nouveau disponible

dga20 va être redémarré cejour 23/11/2018 à 17h

En ce moment, il est très difficile de se connecter à dga20 avec x2go ou NoMachine.
Une nouvelle annonce sera faite lorsque le problème sera réglé

La version 3.5.0 de R est maintenant disponible sur les serveurs du CTIG (dga20,dga-cluster).

Elle est accessible via la commande : R350

Cette version de R est aussi accessible depuis Rstudio-Desktop via la commande : rstudio350

Lors de l'installation ou l'upgrade de Packages, il n'est pas nécessaire de spécifier une librairie. Par défaut, ces packages seront installés ou upgradés dans /bar/lib_R3.5.0 (accessible en lecture-écriture ) de façon à ne pas invalider les éventuelles anciennes versions de packages utilisées par des versions antérieures de R.

Tous les packages déjà installés sont accessibles (sous réserve de compatibilité de version) par cette nouvelle version de R

Cette version sera mise en production le 17 septembre 2018 si des problèmes ne sont pas remontés

La modification de la configuration des files d'attente est terminée.
La documentation a été mise à jour (classes bigmem et unlimitq )
https://forge-dga.jouy.inra.fr/projects/ctig-env-base/wiki/Dga-cluster-utilisateurs